El Departament d’Enginyeria inclou en la seua estructura dos àrees de coneixement, la d’Enginyeria Agroforestal i la de Farmàcia i Tecnologia Farmacèutica.

Cada una d’elles participa en la docència dels cursos de grau i postgrau associats a les seues respectives àrees de coneixement:

• Àrea Enginyeria Agroforestal.
• Àrea Farmàcia i Tecnologia Farmacèutica.